Neke mikrobne značajke mikrobiote povezane sa sluznicom dobivene iz reseciranih uzoraka ileuma povezane su s recidivom u bolesnika s Crohnovom bolešću. Međutim, niti jedna studija nije analizirala mikrobne profile kod pacijenata dok su bili u kirurški induciranoj remisiji kako bi se identificirali znakovi koji bi mogli predvidjeti recidiv.

Istraživači su prospektivno regrutirali multicentričnu kohortu od 262 pacijenta s Crohnovom bolešću koji su bili podvrgnuti resekciji ileokolona (srednja dob pri operaciji, 32 godine; 46,6% žene).

Sveukupno, 944 uzorka biopsije iz neoterminalnog ileuma, debelog crijeva i rektosigmoida dobivena su iz 349 postoperativnih kolonoskopija.

Mikrobna DNA ekstrahirana je iz uzoraka biopsije za sekvenciranje gena 16S rRNA i generirana je 15.345.941 visokokvalitetna sekvenca 16S rRNA. Analizirana je mikrobna raznolikost i taksonomska diferencijalna relativna abundancija.

Rutgeertsov rezultat procijenjen je tijekom svake postoperativne kolonoskopije, s rezultatom ≥ i2 koji ukazuje na endoskopski recidiv.

Devedeset i sedam pacijenata pokazalo je endoskopsku remisiju na prvoj postoperativnoj kolonoskopiji. Od tih bolesnika, kod 25 (25,8%) razvio se endoskopski recidiv, a 72 (74,2%) ostalo je u remisiji nakon druge kolonoskopije.

Mikrobiota ileuma dobivena na prvoj kolonoskopiji pokazala je manju alfa raznolikost, procijenjenu korištenjem Chao1 indeksa, u pacijenata koji su razvili recidiv na drugoj kolonoskopiji nego u onih koji su ostali u remisiji (P < 0,05).

Pacijenti koji su razvili recidiv pokazali su smanjenje u rodu Anaerostipes, čija vrsta može proizvoditi kratkolančane masne kiseline koje igraju ključnu ulogu u homeostazi crijeva, na tri mjesta biopsije. Nasuprot tome, obogaćeno je nekoliko rodova iz razreda Gammaproteobacteria (Klebsiella i Escherichia-Shigella), koji mogu izazvati crijevne upale.

Uključivanje rezultata analize mikrobiote povezane sa sluznicom ileuma i debelog crijeva poboljšalo je predviđanje rizika od recidiva u usporedbi s korištenjem samih kliničkih podataka, posebno za rektosigmoidne uzorke, s površinom ispod krivulje (AUC) od 83,1% za mikrobiom plus klinički podaci naspram 68% samo za kliničke podatke i za uzorke neoterminalnog ileuma, s odgovarajućim AUC-ovima od 79,5% naspram 56,4%.

Koristeći nekoliko svojti koje su pozitivno i negativno povezane s recidivom, uspjeli smo poboljšati predviđanje budućeg endoskopskog recidiva u usporedbi s poznatim kliničkim čimbenicima rizika za postoperativni recidiv Crohnove bolesti, kao što su pušenje i anti-TNF profilaksa.

„Minimalno invazivna fleksibilna sigmoidoskopija mogla bi se koristiti za procjenu mikrobnih biomarkera opisanih u rektosigmoidnoj sluznici u našoj studiji za predviđanje recidiva", napisali su autori.