Prema Programu 2, polisaharidno pneumokokno cjepivo je preporučeno i besplatno za sve osobe starije od dvije godine sa sljedećim medicinskim indikacijama:

• funkcionalna ili anatomska asplenija
• imunokompromitirane osobe (zbog osnovne bolesti ili terapije koju osoba prima)
• imunokompetentne osobe s kroničnim bolestima srca, pluća, bubrega, jetre, dijabetesom melitusom, alkoholizmom, kohlearnim implantatima i stanjima koja dovode do izloženosti cerebrospinalnog likvora infekciji/istjecanja cerebrospinalnog likvora

Dakle, vrlo su široke indikacije za polisaharidno pneumokokno cjepivo.

Konjugirano pneumokokno cjepivo je preporučeno i besplatno za cijepljenje svih osoba od dva mjeseca starosti nadalje  sa sljedećim medicinskim indikacijama:

• funkcionalna ili anatomska asplenija
• imunokompromitirane osoba (zbog osnovne bolesti ili terapije koju osoba prima)
• imunokompetentne osobe s kohlearnim implantatima i stanjima koja dovode do izloženosti cerebrospinalnog likvora (CSL) infekciji/istjecanja CSL-a

Cijepljenje zdravih osoba starijih od 65 godina  protiv pneumokoka nije predviđeno Programom 2.