Voditelj Instituta Nikola Đaković istaknuo je kako je tijekom 35 godina iz te ustanove proizašlo više stotina znanstvenih projekata, najviše iz područja onkologije, interne medicine i otorinolaringologije.

U KBC Sestre milosrdnice kontinuirano se provode i međunarodna istraživanja u suradnji sa svjetskim sveučilišnim centrima i međunarodnim organizacijama, a Institut pruža podršku glavnim istraživačima i suradnicima u kliničkim studijama koje se provode u toj bolnici.

Ustroj današnjeg Instituta počeo je 60-ih godina prošlog stoljeća osnivanjem Laboratorija za eksperimantalnu medicinu (LEM), a 1982. je osnovana Znanstvena jedinica.

Ona je 1989. godine prerasla u Institut za klinička medicinska istraživanja.