Poznata je povezanost ZIKV i malformacija centralnog živčanog sustava fetusa. Kako bi se opisale i utvrdile kliničke manifestacije infekcije kod trudnica i posljedice za novorođenčad, znanstvenici su pratili trudnice kod kojih je utvrđena infekcija u razdoblju od rujna 2015. do svibnja 2016. godine.

U prospektivnu studiju bilo je uključeno 345 trudnih žena, od kojih su 182 imale pozitivan nalaz ZIKV u krvi ili urinu, dokazano tehnikom RT-PCR. Akutna infekcija dogodila se između 6. i 39. tjedna trudnoće. Simptomi koji su se javili kod trudnica su: osip koji svrbi, artralgija, crvenilo očiju, glavobolja, a 27% imalo je povišenu temperaturu. Do lipnja 2016. završene su 134 trudnoće pogođene ZIKV i 73 trudnoće koje nisu bile pogođene virusom, od toga je bio poznat ishod 125 trudnoća iz prve skupine i 61 iz druge skupine. U drugoj skupini 42% žena je imalo infekciju chikungunya virusom, a u prvoj je to bilo kod 3%. U obje skupine postotak fetalnih smrti iznosio je 7%, no 46% trudnoća pogođenih ZIKV imale su nepovoljan ishod. od 117 djece čije su majke bile zaražene, 42% imalo je abnormalnosti mozga, od toga 4 mikrocefaliju. Abnormalnosti su se pojavile bez obzira na to u kojem je trimestru došlo do infekcije ZIKV.

Unatoč blagim kliničkim simptomima majke, infekcija ZIKV velika je opasnost za fetus. Povezuje se s fetalnom smrti, smetnjama u rastu te različitim abnormalnostima centralnog živčanog sustava.